晋商信用增进投资股份有限公司按照现代企业法人治理结构的要求，成立了股东大会、董事会和监事会。经营层下设内控与风险管理委员会、业务风险审查委员会、业务应急处置委员会、安全运营及综合治理委员会、资金管理委员会、集中采购及招投标管理委员会、信息科技建设委员会、考核激励及业绩评估委员会等八个专业化委员会，为公司经营管理提供支持。公司现有党建和人力资源部、办公室、战略规划部、内审合规部、风险管理部、财务管理部、增信项目部、投资项目部、创新项目部、债券交易中心。